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基于G-SSR和EST-SSR标记的鲫6个群体遗传结构分析

作者:甘宝江,庞美霞,俞小牧,童金苟 | 遗传多样性遗传结构

摘要:研究同时利用非编码区和编码区微卫星标记(G-SSR和EST-SSR)分析黑龙江、长江、奉化江及淮河水系共6个野生鲫(Carassius auratus)群体的遗传多样性及遗传结构,并比较2类不同来源SSR用于鲫群体遗传多样性分析的差异。8个G-SSR标记在6个鲫群体中检测到173个等位基因,平均Na、Ne、Ho、He以及PIC分别为22、12.9、0.769、0.893和0.879,群体间Fst值介于0.008—0.085,其中来自黑龙江水系的2个群体与其余水系的所有群体均达到或接近于中等程度的遗传分化,而长江、奉化江和淮河水系4个群体间的遗传分化程度不明显。Nei’s遗传距离介于0.203—0.701;根据遗传距离所绘制的UPGMA聚类图将6个鲫群体划分为2个大分支,其中来自黑龙江水系的2个群体聚为一枝,其余水系群体聚为另一枝。贝叶斯分析也支持这一结果,将6个鲫群体划分为2个最佳理论群。利用8个EST-SSR标记在6个鲫群体中共检测到155个等位基因,平均Na、Ne、Ho、He以及PIC分别为19、9.5、0.728、0.870和0.855;群体间Fst值和Nei’s遗传距离分别介于0.005—0.084和0.117—0.683;基于EST-SSR标记的UPGMA聚类分析和贝叶斯分析也将6个鲫群体划为两大类群:黑龙江水系群体;长江、奉化江和淮河水系群体。G-SSR和EST-SSR标记检测6个鲫群体的平均多态信息含量(PIC)分别为0.786—0.864和0.761—0.833。研究结果显示:6个野生鲫群体均具有较高的遗传多样性,但黑龙江水系群体多样性低于其他水系群体;尽管EST-SSR标记的多态性略小于G-SSR标记,但是2类微卫星标记均揭示了相似的鲫群体遗传结构和分化格局。研究结果对鲫种质资源的保护和EST-SSR标记在鱼类群体遗传学研究价值的评价提供了新的信息。

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水生生物学报

《水生生物学报》是由中国科学院水生生物研究所、中国海洋湖沼学会主办的水生生物学领域的综合性学术刊物,现任主编桂建芳院士。它代表了中国淡水生物学的最高学术水平,是该领域对外交流的一个窗口,在国内外具有较大的影响。本刊创刊于1955年,为16开本双月刊,国内外公开发行。主要刊登与水生态的评价与治理;水生物的生化、遗传、病理、毒理和分类区系;水生物的育种、培养、开发利用和病害防治;渔业生物学报及有关湖沼学的综合调查与研究等相关的中、英文研究论文、研究简报及综述。本刊读者对象:大专院校生物系、水产系、养殖系及环境、生态有关专业的师生;从事水产、淡水生物、水生态和环境保护等方面的科研人员和生产技术工作者及有关科技情报工作者。

《水生生物学报》是中国科技核心期刊、中国科技论文统计源期刊,国内主要被中国期刊全文数据库(CNKI)、万方数据、中文科技期刊数据库(维普网)、《中国科学引文数据库》(CSCD)、《中国科技论文与引文数据库》、中国生物学文摘、环境科学文摘、中国水产文摘、中国地理科学文摘等收录,国外主要被美国《生物文摘》(BA)、《化学文摘》(CA)、《剑桥科学文摘》(CSA)、《水利学与渔业文摘》(ASFA),英国《动物学记录》(ZR)、《农业与生物科学研究中心文摘》(CAB)等收录。于2000年荣获中国科学院优秀科技期刊奖;2002年被评为中国科学院重点资助的百种优秀期刊之一;2006、2008、2010年分别荣获湖北省第五、第六、第七届优秀期刊奖;2008年被评为中国精品科技期刊;在《中国学术期刊评价研究报告》(2009-2010)中,《水生生物学报》被评为“RCCSE中国权威学术期刊”。获奖情况:湖北省十佳重点期刊;中国农学会中国水产学会优秀科技期刊一等奖;中国科学院优秀期刊三等奖;中国期刊方阵“双效”期刊。

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